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Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  39 lines
  1. *****************************************************
  2. * Tubulin subunits alpha, beta, and gamma signature *
  3. *****************************************************
  4.  
  5. Tubulins [1,2], the major  constituent of  microtubules  are dimeric  proteins
  6. which consist of two closely related subunits (alpha and  beta). Tubulin binds
  7. two molecules of GTP at two different sites (N and E). At the E (Exchangeable)
  8. site, GTP is  hydrolyzed during incorporation into the microtubule. Near the E
  9. site is an invariant region rich in glycines which is found in both chains and
  10. which is now [3]  said to control the access of the nucleotide  to its binding
  11. site. We developed a signature pattern from this region.
  12.  
  13. With the exception of the simple eukaryotes, most species express a variety of
  14. closely related alpha and beta isotypes.
  15.  
  16. In most species there is a third member  of the tubulin family: gamma tubulin.
  17. Gamma tubulin is  found at  microtubule  organizing centers (MTOC) such as the
  18. spindle poles or the centrosome, suggesting that it  is involved in the minus-
  19. end nucleation of microtubule assembly [4].
  20.  
  21. -Consensus pattern: [SAG]-G-G-T-G-[SA]-G
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  23.  for maize tubulin beta-2 which has Leu in the first position of the pattern.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: human cbl oncogene.
  25.  
  26. -Note: the first residue in the pattern is Gly in all alpha and beta tubulins,
  27.  and is Ala or Ser in gamma-tubulin.
  28.  
  29. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  30.  
  31. [ 1] Cleveland D.W., Sullivan K.F.
  32.      Annu. Rev. Biochem. 54:331-365(1985).
  33. [ 2] Joshi H.C., Cleveland D.W.
  34.      Cell Motil. Cytoskeleton 16:159-163(1990).
  35. [ 3] Hesse J., Thierauf M., Ponstingl H.
  36.      J. Biol. Chem. 262:15472-15475(1987).
  37. [ 4] Joshi H.C.
  38.      BioEssays 15:637-643(1993).
  39.